יש מגוון סיבות לעקירת שן בינה, צריך לזכור שגם אם שן אינה גורמת נזק כעת, במקרים רבים המיקום שלה או אופן הצמיחה שלה עלול לגרום לסיבוכים עתידיים ולכן עקירה לפני היווצרות הנזק במיוחד כאשר מטופל בריא וצעיר יותר תוביל לעקירה והחלמה קלות יותר. 1.סיכון לזיהומים- כאשר השן כלואה חלקית לא ניתן לנקות אותן ביעילות משום שחלקה נמצאת בתוך החניכיים, המצב יכול להוביל לדלקת סביב רקמה השן (פריקורוניטיס) או זיהומים נרחבים יותר שיכולים לגרום לכאבים, קושי בפתיחת הפה, ריח רע מהפה. 2.נזק לשיניים סמוכות- מיקום המקשה על ניקיון יכול לגרום לעששת בשן הסמוכה כמו כן בשן הבינה עצמה, מיקום ולחץ על שיניים סמוכות יכול לגרום לנזק לשורשי השן הסמוכות 3.ציסטות וגידולים נדירים- במקרים נדירים עלולה להתפתח ציסטה או גידול שפיר סביב כותרת שן בינה כלואה. ציסטה זו עלולה לגרום לספיגת עצם הלסת, עצבים ושיניים סמוכות ואף לגרום לשבר בלסת עקב הפגיעה. 4.כאב כרוני או הפרעה תפקודית- במצבים בהן שן הבינה גורמת לכאבים חוזרים, תחושת לחץ בלסת או כאבי ראש לעיתים ניתן לייחס זאת לקיום שן בינה והפתרון הינו עקירה למרות שאין זיהום. 5.טיפול אורתודונטי- במידה וקיים חסר מקום בקשת השיניים לעיתים יש צורך בעקירת שיני הבינה לטובת אפשרות תזוזת שיניים לפני או במהלך טיפול אורתודונטי 6.עששת עמוקה- לשיני הבינה אנטומיה שאינה צפויה ומיקום שמאוד קשה לגשת אליו, לעיתים לא ניתן לבצע שיקום באזור זה ולכן יש צורך בעקירת השן.